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楊振林
助理教授

個(gè)人簡介:

楊振林博士于中國科學(xué)院上海生命科學(xué)研究院獲得生物化學(xué)與分子生物學(xué)博士學(xué)位,師從杜嘉木教授。隨后在加州大學(xué)伯克利分校/霍華德休斯醫(yī)學(xué)研究院(HHMI)Eva Nogales 教授實(shí)驗(yàn)室開展博士后研究,深入開展真核基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控和染色質(zhì)修飾相關(guān)領(lǐng)域的前沿課題。2025年6月,正式加入南方科技大學(xué)醫(yī)學(xué)院生物化學(xué)系,組建獨(dú)立實(shí)驗(yàn)室。楊振林博士長期致力于染色質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能調(diào)控的分子機(jī)制研究,聚焦與基因表達(dá)調(diào)控和細(xì)胞命運(yùn)決定等核心生命過程相關(guān)分子機(jī)制的解析。其研究結(jié)合分子生物學(xué)、生物化學(xué)、結(jié)構(gòu)生物學(xué)、基因組學(xué)等多學(xué)科交叉技術(shù)手段,揭示了多個(gè)關(guān)鍵調(diào)控因子的功能機(jī)制。以第一作者或通訊作者身份在Science、Cell、Nature Genetics、The Plant Cell等國際頂尖學(xué)術(shù)期刊發(fā)表多項(xiàng)重要研究成果,并獲中國科學(xué)院院長特別獎(jiǎng)、中國科學(xué)院優(yōu)秀博士論文獎(jiǎng)等榮譽(yù)。

 

研究領(lǐng)域:

課題組聚焦染色質(zhì)調(diào)控機(jī)制在細(xì)胞命運(yùn)調(diào)節(jié)與疾病發(fā)生中的作用,研究興趣包括表觀遺傳修飾與染色質(zhì)狀態(tài)轉(zhuǎn)變,染色質(zhì)相關(guān)蛋白復(fù)合物的結(jié)構(gòu)與功能機(jī)制以及表觀調(diào)控因子在癌癥等重大疾病中的作用機(jī)制。課題組致力于通過體外生化重構(gòu)與體內(nèi)細(xì)胞功能驗(yàn)證相結(jié)合的策略,系統(tǒng)揭示染色質(zhì)調(diào)控的分子基礎(chǔ),期望為相關(guān)疾病的機(jī)制解析與靶向干預(yù)提供理論依據(jù)和潛在應(yīng)用價(jià)值。


教育背景:

2013/09-2018/6,生物化學(xué)與分子生物學(xué),博士,中國科學(xué)院上海生命科學(xué)學(xué)院 

2009/09-2013/06,生物學(xué),學(xué)士,西北農(nóng)林科技大學(xué)

 

工作經(jīng)歷:

2020/11-2025/05,博士后,美國加州大學(xué)伯克利分校/霍華德休斯醫(yī)學(xué)研究院  

2020/02-2020/10,研究助理,南方科技大學(xué)  

2018/07-2020/01,博士后,中國科學(xué)院上海生命科學(xué)研究院

 

獲獎(jiǎng)情況及榮譽(yù):

2019,中國科學(xué)院優(yōu)秀博士學(xué)位論文獎(jiǎng)  

2018,中國科學(xué)院院長特別獎(jiǎng)  

2018,中國科學(xué)院優(yōu)秀畢業(yè)生  

2018,北京市優(yōu)秀畢業(yè)生

 

發(fā)表論文:

(*第一或共同第一作者,?通訊作者)

1. Z. Yang*, A. Mameri*, C. Cattoglio, C. Lachance, A. J. Florez Ariza, J. Luo, J. Humbert, D. Sudarshan, A. Banerjea, M. Galloy, A. Fradet-Turcotte, J.-P. Lambert, J. A. Ranish, J. C?té, E?. Nogales?, Structural insights into the human NuA4/TIP60 acetyltransferase and chromatin remodeling complex. Science (2024). Vol 385, Issue 6711, DOI: 10.1126/science.adl58162. 

2. F. Liu*, Z. Yang*?, C. Wang, Z. You, R. Martin, W. Qiao, J. Huang, P. Jacob, J. L. Dangl, J. E. Carette, S. Luan, E. Nogales, B. J. Staskawicz?, Activation of the helper NRC4 immune receptor forms a hexameric resistosome. Cell (2024). 187, 4877-4889.e15

3. Z. Yang*, S. Qian*, R. N. Scheid, L. Lu, X. Chen, R. Liu, X. Du, X. Lv, M. D. Boersma, M. Scalf, L. M. Smith, J. M. Denu, J. Du?, X. Zhong?, EBS is a bivalent histone reader that regulates floral phase transition in Arabidopsis. Nat Genet (2018) 50, 1247–1253.

4. Z. Yang*, Q. Qiu, W. Chen, B. Jia, X. Chen, H. Hu, K. He, X. Deng, S. Li, W. A. Tao, X. Cao?, J. Du?, Structure of the Arabidopsis JMJ14-H3K4me3 Complex Provides Insight into the Substrate Specificity of KDM5 Subfamily Histone Demethylases. The Plant Cell (2018). 30, 167–177

5. X. Du*, Z. Yang*, A. J. F. Ariza, Q. Wang, G. Xie, S. Li, J. Du?, Structure of plant RNA-DEPENDENT RNA POLYMERASE 2, an enzyme involved in small interfering RNA production. The Plant Cell (2022). 34, 2140–2149

6. Q. Wang*, Y. Xue*, L. Zhang*, Z. Zhong, S. Feng, C. Wang, L. Xiao, Z. Yang, C. J. Harris, Z. Wu, J. Zhai, M. Yang, S. Li, S. E. Jacobsen?, J. Du?, Mechanism of siRNA production by a plant Dicer-RNA complex in dicing-competent conformation. Science (2021). 374, 1152–1157

7. C. Zhang*, X. Du*, K. Tang*, Z. Yang, L. Pan, P. Zhu, J. Luo, Y. Jiang, H. Zhang, H. Wan, X. Wang, F. Wu, W. A. Tao, X.-J. He, H. Zhang, R. A. Bressan, J. Du?, J.-K. Zhu?, Arabidopsis AGDP1 links H3K9me2 to DNA methylation in heterochromatin. Nat Commun (2018). 9, 4547

8. S. Qian*, X. Lv*, R. N. Scheid*, L. Lu, Z. Yang, W. Chen, R. Liu, M. D. Boersma, J. M. Denu, X. Zhong?, J. Du?, Dual recognition of H3K4me3 and H3K27me3 by a plant histone reader SHL. Nat Commun (2018). 9, 2425

9. S. Zheng*, H. Hu*, H. Ren, Z. Yang, Q. Qiu, W. Qi, X. Liu, X. Chen, X. Cui, S. Li, B. Zhou, D. Sun?, X. Cao?, J. Du?, The Arabidopsis H3K27me3 demethylase JUMONJI 13 is a temperature and photoperiod dependent flowering repressor. Nat Commun (2019). 10, 1303

10. S. Li*, Z. Yang, X. Du, R. Liu, A. W. Wilkinson, O. Gozani, S. E. Jacobsen, D. J. Patel, J. Du?, Structural Basis for the Unique Multivalent Readout of Unmodified H3 Tail by Arabidopsis ORC1b BAH-PHD Cassette. Structure (2016). 24, 486–494


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